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Re: Du C60 et du C70 dans l'espace !

Publié : 13 août 2010 11:51
par Emile Touron
Ah d'accord merci :)
J'ai pas encore appris ça hein ! ;)

Et c'est bon, j'ai Rasmol. Mais y a-t-il une bibliothèque à télécharger qui contient pleins de molécules ?
J'ai regardé quelques fichiers au bloc-note et j'ai pu traduire. J'ai essayé de faire la molécule d'eau, ça marche.
Voici mon code :

Code : Tout sélectionner

COMPND  TEST.PDB                                                                  
HETATM    1    H                  -0.750   0.000   0.000                
HETATM    2    H                   0.750   0.000   0.000      
HETATM    3    O                   0.000   1.000   0.000
CONECT    1    3                                         
CONECT    2    3
CONECT    3    1     2                               
END   


Mais sur Internet j'ai trouvé ce code :

Code : Tout sélectionner

3
ATOM      1  O                   0.000   0.400   0.000
ATOM      2  H                   0.760  -0.190   0.000
ATOM      3  H                  -0.760  -0.190   0.000

Ils mettent un 3 au dessus (nombre d'atomes ?), ils mettent ATOM au lieu HETATM, et y'a pas de END ni de CONECT...

Tu sais lire ces codes ?

Re: Du C60 et du C70 dans l'espace !

Publié : 13 août 2010 14:13
par Vincent Boudon
Les deux sont bons, mais dans les cas simples le second suffit.

HETATM veut dire "hétéro-atome", ça sert à représenter des trucs complexes, comme des sous-groupes d'atomes dans des très grosses molécules (protéines, ADN, ...). Ca marche ici , mais ce n'est pas utile, ATOM suffit.

CONECT sert à forcer les liaisons chimiques. Mais pour les molécules simples, Rasmol trouve les liaisons tout seul.

Si il y a une série de CONECT, il faut un END à la fin.

Je n'ai pas de banque de fichiers spécifiques, mais comme je t'ai dit il suffit de chercher NomDeLaMolecule.pdb ou FormuleChimique.pdb dans Google et on trouve tout ce qu'on veut.

J'ajoute que d'autres softs lisent le format pdb, comme iMol (gratuit, bien sûr) sur Mac, par exemple.

Re: Du C60 et du C70 dans l'espace !

Publié : 13 août 2010 15:04
par Emile Touron
D'accord merci :)

Re: Du C60 et du C70 dans l'espace !

Publié : 27 oct. 2010 23:54
par Vincent Boudon
D'autres nouvelles fraîches ! Le télescope infrarouge Spitzer de la NASA confirme que C60 est une molécule abondante, en particulier dans les nébuleuses planétaires !

La suite par ici :

http://www.jpl.nasa.gov/news/news.cfm?r ... id=7250333" onclick="window.open(this.href);return false;

Re: Du C60 et du C70 dans l'espace !

Publié : 28 oct. 2010 00:51
par Eric Chariot
Et l'an prochain, le thème de la FS est la chimie...

Avec notre nouvelle convention, on pourrait tout à fait le faire en commun avec l'ICB non ?

Re: Du C60 et du C70 dans l'espace !

Publié : 28 oct. 2010 07:59
par Vincent Boudon
Voui ;)

Re: Du C60 et du C70 dans l'espace !

Publié : 30 oct. 2010 16:53
par Mag
Et l'an prochain, le thème de la FS est la chimie...
Le thème de la nuit des chercheurs sera l'ordre et le désordre
(mais rien à voir avec le C60 et le C70 bien sûr, c'est juste pour info)

Re: Du C60 et du C70 dans l'espace !

Publié : 30 oct. 2010 17:15
par Vincent Boudon
Hmmm, en cherchant bien dans les spectres, ça peut avoir un rapport ...

Et avec la chimie, ça en a, en tous cas.

Merci pour l'info !